Na Ilha do Cardoso, podemos ver quatro tipos de Ecossistemas, sendo cada um com seu tipo de Vegetação e seu fator Abiótico.
Dois movidos pela Água, que são o Costão Rochoso e o Manguezal e Dois movidos pelo Ar, que são a Restinga e a Mata Atlântica.
Ecossistemas movidos pela Água
Costão Rochoso
É o nome do ambiente costeiro formado por rochas na transição entre os meios terrestre e aquático. É considerado muito mais uma extensão do ambiente marinho que do terrestre, uma vez que a maioria dos organismos que o habitam, estão relacionados ao mar. Onde que na parte de cima podemos ver algumas plantas, na parte do meio alguns animais tais como Répteis, Aves e etc... e na parte de baixo podemos ver aqueles animais menores, aquáticos ou terrestres como Siris e etc...
Manguezal
O manguezal é considerado um ecossistema costeiro de transição entre os ambientes terrestre e marinho.
O ecossistema manguezal está carácterizado às margens de baías, enseadas, barras, desembocaduras de rios, lagunas e reentrâncias costeiras, onde haja encontro de águas de rios com a do mar, ou diretamente expostos à linha da costa. A cobertura vegetal, ao contrário do que acontece nas praias arenosas e nas dunas, instala-se em substratos de vasa de formação recente, de pequena declividade, nessa área existe a água "Salobra" ( água Doce + Salgada )
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